Il metodo didattico della Scuola Scodanibbio si basa su una diversificazione dei programmi in base alle richieste ed alle età degli studenti. I docenti utilizzano molteplici metodologie e diversi approcci didattici innovativi al fine di una più completa formazione degli studenti. Il modello educativo e formativo della scuola riprende quello dei conservatori di musica strutturando un piano di studi personalizzato ad hoc per ogni singolo studente composto, oltre che dalla tradizionale lezione individuale di strumento, da una serie di materie complementari che si articolano in lezioni collettive quali Teoria ritmica e percezione musicale, Storia della musica, Coro di voci bianche o polifonico, Musica da camera o d’insieme. Tutte le materie d’insegnamento sopracitate sono comprese nella quota mensile di frequenza e concorrono complessivamente alla formazione a 360° del musicista fin dalla tenera età. Gli studenti di ogni età sono invitati a partecipare a saggi pubblici, masterclass, verifiche di fine anno e molte altre iniziative quali concorsi, scambi con altre scuole, progetti Erasmus, nella convinzione che praticare la musica d’insieme sia una componente imprescindibile del percorso di crescita di un musicista ed esperienza di alto valore formativo per tutti i bambini e ragazzi.
La scuola promuove anche la possibilità, come avvio allo studio dello strumento musicale, di lezioni collettive in piccoli gruppi (3 - 4 allievi al massimo) omogenei per età e con costi contenuti. Per la teoria dei neuroni a specchio l’apprendimento del gesto viene raddoppiato, triplicato. La lezione condivisa ha un valore didattico di comprovata efficacia, con risultati importanti per quel che concerne il coinvolgimento emotivo, l’ascolto e la motivazione; favorisce i legami tra gli allievi avendo maggiori occasioni di confronto.